Jeg løb ind i det samme SQLite/Postgres-problem med Flask og SQLAlchemy, svarende til Gordon Fierce. Min løsning var dog anderledes. Postgres er strenge omkring bordlåse og -forbindelser, så det løste problemet for mig eksplicit at lukke sessionsforbindelsen ved nedtagning.
Min arbejdskode:
@pytest.yield_fixture(scope='function')
def db(app):
# app is an instance of a flask app, _db a SQLAlchemy DB
_db.app = app
with app.app_context():
_db.create_all()
yield _db
# Explicitly close DB connection
_db.session.close()
_db.drop_all()
Reference:SQLAlchemy