Det ser ud til at have noget at gøre med, hvordan dine INSERT-sætninger er dannet. Se denne violin , som er lidt ændret i forhold til dit eksempel. I dette tilfælde får du ikke huller (men det vil du sandsynligvis, hvis du tilføjer flere indlæg... det gør det faktisk .).
EDIT:Efter en lille smule mere graving fandt jeg ud af, at du ikke får huller, hvis du bruger MyISAM-motoren (i modsætning til InnoDB). Så måske er det en fejl eller et mærkeligt designvalg i InnoDB...?
EDIT 2:Yderligere gravearbejde har afsløret denne fejl
, indgivet mod InnoDB-lagringsmotoren. Det matcher det originale spørgsmåls use-case meget nøje. Der er ikke givet nogen løsning på fejlen, men det ser ud til, at en løsning er at indstille innodb_autoinc_lock_mode til 0 i din my.cnf-fil før opstart af mysqld.