Jeg har logget på en mysql-logtabel med en cron, der knuser den.
Jeg bruger generelt innodb tabeller i mine apps, men for logtabellen gjorde jeg det som myisam og brugte insert DELAYED . . . forespørgsler.
Myisam leverer ikke alt det gode ved innodb, men jeg tror, det er lidt hurtigere (af den grund).
Det vigtigste, du er bekymret for, er databaselåsning, når din cron kører, men ved at bruge "indsæt forsinket" kommer du for det meste uden om dette problem.