Flyt $path = "images/"; inde i for-løkken. Ellers tilføjer du filnavnet uden at nulstille det efter hver iteration. Faktisk behøver du slet ikke bruge en variabel til det præfiks. Du kan blot skrive 'images/' . md5(uniqid()) . "." . $ext[count($ext)-1] straks.
For at skrive værdierne til databasen kan du enten køre forespørgslen i hver iteration også eller tilføje stierne til et array, som transformeres til den kommaseparerede indsættelsesliste i henhold til SQL-syntaksen.