At sætte jar-filen i $glassfish-v3-install-root/glassfish/lib viste sig at være korrekt.
Den
"SEVERE: RAR5111 : Error casting to javax.sql.Datasource java.lang.ClassCastException: com.mysql.jdbc.Driver cannot be cast to javax.sql.DataSource"
fejlen var, tror jeg, forårsaget af en forkert indstilling for jdbc-pooling på glassfish-serveren. Men gå til administrationskonsollen, tilgængelig fra Netbeans "server"-fanen, gå til "JDBC", "Connection Pools", vælg "java.sql.driver" som ressourcetype og "com.mysql.jdbc.driver" da førerens klassenavn vil slippe af med casting-problemet.
Klik på knappen "Ping" nær toppen for at sikre dig, at du opretter forbindelse.