Der er ingen måde at organisere tabeller hierarkisk på, som er meningsfuldt for MySQL.
Som andre har bemærket, kan du opretholde separate skemaer (i MySQL, databaser), eller du kan udvikle og bruge en tabelnavnestruktur, der organiserer dine tabeller på en måde, der er meningsfuld for brugerne (men stadig ikke er meningsfuld for MySQL).