Som andre sagde, kan du ikke bruge kommandoen source
i MySQLdb Python API
Så i stedet for at køre det, indlæs filen og kør den
Lad os sige, at din .sql-fil har
create database test;
Læs indholdet som
sql=open("test.sql").read()
Og udfør det derefter
cursor.execute(sql);
Du får en ny database "test"