Jeg havde lige problemet og indså, at jeg lavede en database med navne med '_test ' suffikser.
Det sker, at phpmyadmin har en funktion til at skjule nogle DB'er. For at ændre denne adfærd kan du navigere til:indstillinger> funktioner> generelt> Skjul databaser
Som standard har skjulte databaser disse mønstre:information_schema|mysql|performance_schema|test|phpmyadmin