Du forsøger i øjeblikket at opdatere baseret på en streng, ikke et ObjectId.
Sørg for at initialisere et nyt ObjectId fra strengen, når du bygger din forespørgsel:
mongoDB.getCollection("restaurants").updateOne(
new BasicDBObject("_id", new ObjectId("56110fe1f882142d842b2a63")),
new BasicDBObject("$set", new BasicDBObject("zipcode", "10462"))
);