Jeg kan bekræfte, at det bestemt er noget med OS, da jeg har opdateret og også løber ind i det samme problem. Jeg er i gang med at grave i det, hvis jeg finder noget, vil jeg fortælle dig det!
OPDATERING:
Efter at have undersøgt noget ser det ud til, at det har at gøre med den Go-afhængighed, som MongoDB bruger. MongoDB bruger i øjeblikket v1.4.2. Det viser sig, at der er problemer med ældre versioner af Go på macOS Sierra. https://github.com/golang/go/issues/16570 forklarer, at problemet er løst med v1.7. Medmindre der er en måde, hvorpå du kan få MongoDB til at pege på Go v1.7, er jeg ikke sikker på, om dette vil blive løst, før MongoDB opgraderer deres afhængigheder.
OPDATERING 2: Jeg havde planer om at indsende en fejl til MongoDB vedrørende problemet, indtil jeg faldt over dette... https://jira.mongodb.org/browse/TOOLS-1450 . Det ser ud til, at MongoDB 3.2.10 vil bruge Go v1.7 og burde løse de problemer, som du og jeg ser.