Dette er den forespørgsel, du skal bruge:
db.collection.update( { "Queries.Results.id":1 }, { $pull: { "Queries.$.Results": {"id":1} } } )
Du skal angive "hvor"-sætningen for at finde det dokument, der skal opdateres. Du mangler også positionsoperatoren $, du skal bruge den, fordi forespørgsler kan have flere resultater.