$nin er en forespørgselsoperator ikke en aggregeringsoperator og også $expr understøtter kun aggregation operatorer ikke query dem. Så du skal nok bruge $not $in med $expr udtryk på denne måde
{
"$match": {
"$and": [
{
"$or": [
{
"Multi_User": {
"$exists": False
}
},
{
"$expr": {
"$not": { "$in": ["$CreatedBy", "$Multi_User"] }
}
}
]
}
]
}
}