Jeg har selv løst dette problem ved at slette mongodb-27017.sock fil. Jeg kørte tjenesten efter at have slettet denne fil, hvilket fungerede fint. Jeg er dog stadig ikke sikker på årsagen til problemet. Outputtet af kommandoen ls - lat /tmp/mongodb-27017.sock er nu
srwx------ 1 mongodb nogroup 0 Apr 23 06:24 /tmp/mongodb-27017.sock