Opsæt flere 'forbindelsesgrupper' for hver server i din database.php-konfigurationsfil og derefter i modellen:
$DB1 = $this->load->database('group_one', TRUE);
$DB2 = $this->load->database('group_two', TRUE);
//read from DB1
$DB1->query();
//write to DB2
$DB2->insert();
Se eksempler i:Opret forbindelse til flere databaser