Tilladelserne bør ikke have nogen betydning for Nginx, så længe dæmonen kan læse den, så root: og 744 er sandsynligvis ideelle.
Som en note, generelt alle filer i /etc/ skal ejes som root:root og generelt 744 medmindre det er sikkerhedskritisk for at forhindre farlig manipulation af brugere eller udnyttede tjenester (hvor tilladelserne bør være endnu mere restriktive som f.eks. root:root 600 ).