Som jeg forstår sintaksen fra MySQL, når du sætter USING for en Inner Join, skal kolonnerne hedde det samme i begge tabeller. Der er ingen kolonne med navnet maxdate på indholdstabellen, så fejlen springer. Du kan muligvis prøve (hvis jeg forstår tingene rigtigt)
SELECT func_id,checksum
FROM Content cnt
INNER JOIN (
SELECT func_id, MAX(timestamp) AS maxdate
FROM Content GROUP BY func_id
) AS max ON (cnt.func_id=max.func_id AND max.maxdate=cnt.timestamp);