1064, Du har en fejl i din SQL-syntaks;... Python MySQL

data værdi er en liste og du prøver at formatere det til forespørgslen. Og brug ikke strengformatering til at indsætte variabler i en forespørgsel - brug en korrekt forespørgselsparametrering i stedet:

cursor.execute("""
    UPDATE 
        tplinkus_rma.rma_order 
    SET 
        rma_num=%s 
    WHERE 
       order_id=%s""", (data[0], Id))

Bemærk, hvordan forespørgselsparametrene placeres i en tuple og sendes som et separat argument.