Jeg tror, at dine spørgsmål stort set blev besvaret i det forrige spørgsmål, du henviste til.
1) Når du opretter tabellen. InnoDB giver flere fordele end blot låsning på rækkeniveau. Bedre hastighed, når du har flere sql-klienter, der opdaterer, mindre risiko for datatab/korruption, referenceintegritet osv... Med kun få transaktioner pr. sekund (TPS) vil du sandsynligvis ikke se forskel på ydeevnen, men InnoDB er mere pålidelig og skalerer bedre.
2) Med kun 2-3 TPS vil du ikke se nogen væsentlig forskel mellem InnoDB og MyISAM. Selv på semi-gammel hardware.
FYI, et moderne diskdrev burde være i stand til at håndtere mindst ~200 opdateringstransaktioner pr. sekund.
Jeg anbefaler, at du læser op på InnoDB , MVCC og ACID .