Ok jeg løste. Jeg satte manuelt mysql-connector-java-5.1.18-bin.jar
i min sdk-mappe:
file:///opt/appengine-java-sdk-1.6.0/lib/impl/
Fejlændringer i en mere komfortabel:
java.sql.SQLException: Access denied for user 'root'@'localhost' (using password: YES)
Men tak for forslagene