Jeg har brugt meget MS SQL Server. Den største forskel er, at MS SQL Server kun fungerer med Windows-platformen. MySQL fungerer med alle platforme. MySQL er open source og nu købt af Oracle, så ingen kender MySQL's skæbne. Hvis du arbejder med .NET eller Windows platform, vil jeg foreslå at arbejde med MS SQL, ellers er det oplagte valg MySQL. LAMP bruger MySQL. Store virksomheder som Facebook bruger LAMP og dermed MySQL. Mange banker som Chase bruger .NET og derfor mest MS SQL Server. Hvis du er en Windows-fan, så gå efter MS SQL server. Hvis du er en fyr, der tror på Open source, så gå efter MySQL.