Det lykkedes mig at sikkerhedskopiere og gendanne blobs ved at bruge følgende mysqldump-kommando:
mysqldump --opt --skip-extended-insert --max_allowed_packet=128M -u root myDB > filename
Ikke sikker på, om den angiver max_allowed_packet på kommandolinjen eller skip-extended-insert det gjorde tricket.
Jeg antog, at min max_allowed_packet af 32M blev brugt, men jeg tror, at i mysql-konfigurationsfilen er den i [mysqld]-sektionen og gælder derfor sandsynligvis ikke for dump.
Jeg forstår stadig ikke, hvorfor jeg ikke fik nogen fejl på hverken dumpet eller gendannelsen.