Muligt at du har nogle store indsæt-sætninger, der er større end din max størrelse. Tjek din /etc/mysql/my.cnf fil eller hvor den er. Kan ikke huske, hvad standarden er - men at sætte den til noget stort som nedenfor kan hjælpe.
Dette er en mulighed
[mysqld]
max_allowed_packet = 16M
Og måske den anden vej
[mysqldump]
max_allowed_packet = 16M