Jeg stod over for samme problem. Det viser sig, at systemet ikke er i stand til at få adgang til hibernate-configuration-3.0.dtd fra den angivne url.
<DOCTYPE hibernate-configuration PUBLIC
"-//Hibernate/Hibernate Configuration DTD 3.0//EN"
"http://www.hibernate.org/dtd/hibernate-configuration-3.0.dtd">
Så jeg henviste til det fra det lokale system.
<!DOCTYPE hibernate-configuration SYSTEM
"classpath://org/hibernate/hibernate-configuration-3.0.dtd">
Fungerede godt for mig. Håber det hjælper!