MySQL Workbench kører på Windows og Linux. Den kommercielle version giver dig mulighed for at lave omvendt udvikling og redigere strukturen af en live database, med den gratis, du først skal dumpe strukturen til en fil. Dens forfader DBDesigner er lidt ældre, men har ikke denne begrænsning. Windows og Linux også.
Hvis disse to er overkill, kan du prøve med HeidiSQL , efterkommer af MySQLFront. Den kører kun på Windows, men der er en alfaversion, der kører på Java.