Efter megen søgning var jeg i stand til at løse problemet "PID-fil kan ikke findes" på min maskine. Jeg er på OS X 10.9.3 og installerede mysql via Homebrew.
Først fandt jeg min PID-fil her:
/usr/local/var/mysql/{username}.pid
Dernæst fandt jeg min my.cnf-fil her:
/usr/local/Cellar/mysql/5.6.19/my.cnf
Til sidst tilføjede jeg denne linje til bunden af my.cnf:
pid-file = /usr/local/var/mysql/{username}.pid
Forhåbentlig virker dette for en anden og sparer dig for hovedpine! Glem ikke at erstatte {brugernavn} med din maskines navn (jeffs-air-2 i mit tilfælde).