Se dette svar
. Det ser ud til, at MySQL-driveren skal være i {$TOMCAT]/lib
delt mellem applikationer. Tjek, at du ikke inkluderer det med hver ansøgning. Det virkede i hvert fald for mig, og jeg har kunnet fjerne advarslen.
Hvis du bruger Maven, skal du markere afhængigheden som angivet.
OPDATERING:
hovedårsagen er, at Tomcat har problemer med at afhente driveren, fordi den er registreret i en fælles for flere applikationer. Lukning af et program tillader ikke Tomcat at frigive driveren. Se dette svar
.