LIKE
bruger ikke fuldtekstindekset. For at gøre brug af fuldtekstindekset skal du bruge match (som du sagde):
SELECT *
FROM myTable
WHERE MATCH(field) AGAINST ('aaa*' IN BOOLEAN MODE)
ORDER BY field2
MySQL-manualen har et omfattende kapitel om Fuldtekstsøgefunktioner .