Hvis du vil læse artiklen her:https://dba.stackexchange.com/questions/692/sql-server-2008-cross-database-performance-on-same-physical-machine-and-server du vil indse, at du ikke vil have præstationsstraf, fordi forespørgselsoptimering kun vil være én. Forskellen vil kun være, hvis du vil bruge forespørgsler på tværs af forekomster. I dette tilfælde vil forespørgslen blive analyseret af separate forespørgselsanalysatorer på begge forekomster.
Mulige problemer, der kan være i dit tilfælde, er relateret til administration. Læs, hvordan du administrerer ejerskab på tværs af databaser her:http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms188676.aspx