Til sidst "løs" problemet med at kompilere fra kilden postgis 2.2.2 (der også kræver gdal, proj4 og geos) og derefter udstedelse
CREATE EXTENSION postgis;
CREATE EXTENSION postgis_topology;
siden DROP EXTENSION postgis;
fortæller mig, at postgis ikke var til stede længere.
Og til sidst:
ALTER EXTENSION postgis UPDATE TO '2.2.2';
ALTER EXTENSION postgis_topology UPDATE TO '2.2.2';
Fik igen adgang til mine geomdata og funktioner fra PostgreSQL 9.4. Det ser ud til, at kompilering fra kilden korrekt opdaterede variabelstien til postgresql og installerede /usr/lib/postgresql/9.4/lib/postgis-2.2.så den var ikke til stede længere (også for postgis-2.1.so), selv med (gen)installerer fra apt-get.
Håber dette vil hjælpe.