Heroku bruger et skrivebeskyttet filsystem, hvilket betyder, at lokale filsystembaserede databaser som SQLite3 ikke er kompatible med deres infrastruktur. Og mig bekendt har det aldrig været muligt at skubbe fra en SQLite3 db direkte til Postgres på Heroku.
Du bør migrere dine data til en lokal Postgres-database og skubbe derfra.