For ubuntu (jeg brugte ubuntu 12.04), kan standard phpmyadmin apache-konfigurationen findes på /etc/phpmyadmin/apache.conf
Du kan åbne den ved at skrive sudo nano /etc/phpmyadmin/apache.conf og ændre den tredje
Alias /yournewalias /usr/share/phpmyadmin
Glem ikke at genstarte apache-tjenesten,
sudo service apache2 restart