Når du opretter en ny kolonne, tildeles en standardværdi (i dit tilfælde vil være 0), så du skal specificere, hvilke værdier den vil have (udover at du kan fortælle den til kolonnen, at den skal være autoinkrementel, og den vil gøre arbejdet for dig for de nye indtastninger af rækker). Du skal ændre alle værdierne for at være forskellige mellem dem, id-nøglen SKAL være unik
For at ændre alle dine id'er kan du i mysql gøre:
SET @new_id=0;
UPDATE your_table
SET id = @new_id := @new_id + 1
where id = 0