Jeg løb selv ind i det samme i dag efter at have opdateret til 4.6.0, hvad jeg gjorde for at løse problemet var at slette indholdet af phpmyadmin-mappen undtagen config-filen (config.inc.php i roden). Når det var gjort, uploadede jeg 4.5.4 igen, som kan hentes herfra https://github .com/phpmyadmin/phpmyadmin/tree/MAINT_4_5_4 klik bare på download zip øverst til højre, og dette er i øvrigt deres officielle repo.
