Er det muligt at bruge forespørgselsprojektion på den samme samling, som har en $elemMatch-projektion?

Ja, der er to måder at gøre dette på. Så du kan enten bruge $elemMatch på projektionssiden, som du allerede har, med små ændringer:

 Model.findById(id,
   { "comments": { "$elemMatch": {"created.by": "Jane" } } },
   function(err,doc) {
 
 Eller bare føj til forespørgselsdelen og brug den positionelle $ operatør:
 Model.findOne(
    { "_id": id, "comments.created.by": "Jane" },
    { "comments.$": 1 },
    function(err,doc) {
 
 Enten måde er fuldkommen gyldig.
 
 Hvis du ville have noget lidt mere involveret end det, kan du bruge .aggregate()  
 metode, og det er $project  
 operatør i stedet:
 Model.aggregate([
    // Still match the document
    { "$match": "_id": id, "comments.created.by": "Jane" },

    // Unwind the array
    { "$unwind": "$comments" },

    // Only match elements, there can be more than 1
    { "$match": "_id": id, "comments.created.by": "Jane" },

    // Project only what you want
    { "$project": {
        "comments": {
            "body": "$comments.body",
            "by": "$comments.created.by"
        }
    }},

    // Group back each document with the array if you want to
    { "$group": {
        "_id": "$_id",
        "comments": { "$push": "$comments" }
    }}
],
function(err,result) {
 
 Så aggregeringsrammen kan bruges til meget mere end blot at aggregere resultater. Det er $project  
 operator giver dig mere fleksibilitet, end der er tilgængelig for projektion ved hjælp af .find() . Det giver dig også mulighed for at filtrere og returnere flere array-resultater, hvilket også er noget, der ikke kan gøres med projektion i .find() .