Prøv denne, det virkede for mig:
db.<your collection>.find({"a_list_of_dbrefs.$id": ObjectID("4e2d48ab580fd602eb000004")})
Du kan også hente alle elementer, der har referencen til samlingen:
db.<your collection>.find({"a_list_of_dbrefs.$ref": "somecollection"})