Du kan køre flere mongod-processer på den samme maskine på forskellige porte og pege på forskellige datamapper og gøre dem til en del af det samme replikasæt.
http://www.mongodb.org/display/DOCS/Starting +og+Stop+Mongo
mongod --dbpath c:/data1 --port 12345 --replSet foo
mongod --dbpath c:/data2 --port 12346 --replSet foo
og tilslut derefter til en af mongod-processerne ved hjælp af mongo-konsollen og tilføj start replikasættet ved at bruge instruktionerne beskrevet her:
http://www.mongodb.org/display/DOCS/Replica+ Indstillinger+-+Grundlæggende