Edit:Til din orientering:efter at have søgt i to dage i træk uden at finde et svar oprettede jeg en billet til en mulig fejl på Mongoose.js Github, og de bekræftede mit problem. Ifølge dem er det rettet i den nye 4.0.0-udgivelseskandidat , som ikke anbefales til produktiv brug. At løste faktisk mit problem, men rc1'en lavede endnu flere problemer.
Min løsning indtil videre:
Endelig blev jeg så irriteret over denne fejl, at jeg ændrede hele min kumulering af den tabel, så _id har ikke et separat from_node_id Mark. Jeg bruger from_node_id nu som ID direkte.