Hvad du timing her, er den tid, det tager node at starte, indlæse mongo-modulet og først derefter oprette forbindelse. Du vil opdage, at det meste af dette ikke er at oprette forbindelse til selve databasen, men snarere at analysere, indlæse og udføre hele scriptet.
Prøv at køre timingen inde fra scriptet efter mongodb modulet er blevet indlæst.