Jeg ved, at dette er gammelt, men jeg løb ind i problemet og faldt over dette spørgsmål. Det lykkedes mig at løse det.
Mit problem var på Ubuntu 18.04 og forsøg på at installere og køre MongoDB 3.4/3.6.
Det ene problem var en manglende /var/run/mongodb-mappe med de relevante tilladelser, det andet var denne fejl. Jeg er stadig ikke 100 % sikker på, om denne fejl var relateret til mappen eller ej, men det havde bestemt noget at gøre med konfigurationerne.
Min mongod.conf endte med at have processManagement - gaffel sat til true. Ændring af det til falsk tillod det at begynde at virke.