Et hurtigt greb af kildetræet ser ud til at indikere, at unikke indekser kun bruges ved indsættelse, så der burde ikke være nogen ydeevnefordel eller skade mellem en forespørgsel, der returnerer ét dokument, uanset om indekset er unikt eller ej.
MongoDB-indekser er implementeret som btræer, så det ville ikke give nogen logisk mening for dem at udføre anderledes, uanset om indekset er unikt eller ej.