du kan oprette en javascript-løkke, der gør jobbet og derefter udføre det i mongokonsollen.
var dbs = db.getMongo().getDBNames()
for(var i in dbs){
db = db.getMongo().getDB( dbs[i] );
print( "dropping db " + db.getName() );
db.dropDatabase();
}
gem det til dropall.js og kør derefter:
mongo dropall.js