Starter med Mongo 2.6.0 du kan gøre dette naturligt uden yderligere manipulation.
db.<collection>.aggregate( [
{ <operation> },
{ <operation> },
...,
{ $out : "<output-collection>" }
] )
Tjek den nye aggregeringsoperator $out for et mere detaljeret eksempel.
P.S. på denne måde er du ikke begrænset til 16 Mb størrelse.