Du vil have whereIn
med en række af dine id'er, der skal kontrolleres...
$news = News::whereHas('newsCategories', function($q) use($array_of_ids)
{
$q->whereIn('category_id', $array_of_ids)
->orderBy('created_at', 'desc');
})->get();
Bare sørg for, at du passerer noget, der virkelig er en række :)