MyISAM er hurtigere, når forespørgslen er enkel, men den er meget langsommere i et miljø med høj samtidighed, da dets tabelniveaulås sammenlignet med InnoDBs rækkeniveaulås.
En MyISAM-tabel kan ganske enkelt blive et hotspot og sænke hver forbindelsesforespørgsel, så det er bedst at undgå at bruge det.