Prøvede du at bruge innobackupex
manuskript? Det giver mulighed for at køre levende database (hot backup) og tar|gzip endelig backup, så du kan få en mindre fil. Virker kun med file_per_table=1
Hvis du har nedetid for at flytte databasen, kan du også prøve at optimere tabeller for at genvinde noget plads (især hvis du har slettet mange).
Du kan også overveje at slippe af med nogle data:logfiler, arkiver osv. og flytte dem senere.