Jeg bemærker, at mange af dine InnoDB-tråde sidder fast i tilstanden "rydde op."
Der er en fejl https://bugs.mysql.com/bug.php?id=78777 om tråde, der sidder fast i den tilstand. Det er rapporteret at være rettet i MySQL 5.6.35, 5.7.17, 8.0.1. Du bør opgradere til disse versioner, hvis du ikke allerede har gjort det.
Et andet forslag er at øge størrelsen på table_open_cache . Overvåg statusvariablerne Open_tables og Opened_tables .
Mere læsning:
- https://dev.mysql.com/ doc/refman/5.7/da/table-cache.html
- https://dba.stackexchange.com/ question/45551/how-to-optimize-table-cache for nogle tips.