Det er en traditionel begrænsning af MySQL Workbench. Du kan ikke åbne 2 modeller på samme tid i en enkelt forekomst af MySQL Workbench. På nogle platforme (såsom Windows) kan du dog åbne flere instanser (bare vær forsigtig, når du ændrer indstillinger, forbindelser osv., da de deles mellem alle instanser, sidste lagring vinder).
På Windows skal du muligvis aktivere flere forekomster først ved at ændre indstillingen under Edit > Preferences > Others (tab) :
