MySQL går ned (nogle pointere kan være ugyldige og få dumpet til at afbryde)

Du kunne overveje at ændre disse egenskaber for mysql-serveren:

nano /etc/mysql/my.cnf

query_cache_size=16M
key_buffer_size=256M

Eller måske endda prøve at øge den tilladte udførelsestid for forespørgslen fra mysql-klienten:

SET GLOBAL MAX_STATEMENT_TIME=1000;

før du udfører din forespørgsel.