MySQL-optimering på jointabeller med rækkeviddekriterier

chrom_only er sandsynligvis et dårligt indeksvalg for din joinforbindelse, da du kun har chrom 22-værdier.

Hvis jeg har fortolket dette rigtigt, skulle forespørgslen være hurtigere, hvis jeg bruger start_end

SELECT `inVar`.chrom, `inVar`.pos, `openChrom_K562`.score
FROM `inVar`
LEFT JOIN `openChrom_K562`
USE INDEX (`start_end`)
ON (
`inVar`.chrom=`openChrom_K562`.chrom AND
`inVar`.pos BETWEEN `openChrom_K562`.chromStart AND `openChrom_K562`.chromEnd
)