Hvordan får man værdien fra Javascript Prompt Box og sender den til PHP-variabelen for at kunne gemme i SQL?

Du kan sende værdi til skjult input i formularen og indsende den.

function MyReason(){
    var reason = prompt("Reason");
    document.getElementById("reason").value = reason;
    document.getElementById("form").submit();
}

<form id="form">
    <input type="hidden" id="reason" />
</form>